Crustacé amphipode (Epiméria sp.)
Equipements
Scanners laser et à lumière structurée
Cette technologie repose sur la projection d’un faisceau laser ou d’un motif de lumière structurée pour balayer une surface et générer un nuage de points en trois dimensions. Elle permet d’obtenir des modèles 3D de surface très détaillés pour des objets allant de 5 cm à 25 m. Certains appareils permettent également la capture de texture et de couleur.
Dans le cadre du projet e-COL+, plusieurs équipements ont été acquis :
- Scanners laser : Faro Edge Arm, Faro Quantum Prizm
- Scanners à lumière structurée : gamme Artec (Micro, Eva, Space Spider), GoScan Spark (Creaform), ce dernier étant particulièrement performant pour la rapidité de traitement.
Ces technologies sont bien adaptées aux collections d’histoire naturelle en raison de leur rapidité de numérisation et de post-traitement.
Photogrammétrie
La photogrammétrie consiste à reconstituer la forme, les dimensions, la position et la texture d’un objet à partir d’un ensemble de photographies prises sous différents angles. Elle permet de produire des modèles 3D texturés pour des objets de 1 mm à 110 m.
Si le matériel nécessaire est relativement accessible, la production de modèles de qualité professionnelle exige un studio spécialisé. La méthode présente des limites techniques, notamment pour les spécimens de très petite taille ou à textures complexes. Néanmoins, des marges de progrès importantes existent, et le projet e-COL+ intègre un axe de recherche et développement pour améliorer ces rendus.
Microtomographie à rayons X
La microtomographie repose sur l’acquisition de radiographies d’un objet sous différents angles, afin de reconstruire son volume interne à partir des variations d’absorption des rayons X. Elle produit une pile d’images dont la résolution peut atteindre quelques microns, restituant ainsi la structure interne en 3D, avec possibilité de segmentation fine des tissus.
Le projet e-COL+ a permis l’acquisition de deux microtomographes RX Solutions : EasyTom S130 (MNHN) et EasyTom S150 (UBE). Ces appareils permettent une résolution jusqu’à 2,5 microns, idéale pour l’étude détaillée de la morphologie interne des spécimens.
Les spécimens de l’UCBL numérisés par microtomographie à rayons X, principalement des vertébrés, sont traités par le Double Tomographe à Haute Energie (DTHE) du Laboratoire MATEIS de l’INSA Lyon, avec lequel le Laboratoire de Géologie de Lyon a établi une convention.
Filières externalisées de numérisation
Dans le cadre du projet e-COL+, deux prestataires externes ont été mobilisés pour augmenter notre capacité de numérisation :
- Novitom (Grenoble)
- RX Solutions (Annecy).
Novitom réalise des acquisitions de très haute résolution au synchrotron européen (ligne BM05 et BM18 de l’ESRF), avec une taille de voxel comprise entre 1 µm et 6 µm pour des spécimens de 1 à 15 mm de longueur. Ces prestations concernent principalement les arthropodes. Environ 1 500 spécimens seront numérisés entre 2024 et 2026.
RX Solutions, dont les équipements sont comparables à ceux du MNHN et d’UBE, prend en charge la numérisation de vertébrés (oiseaux, reptiles, amphibiens, mammifères) ainsi que d’arthropodes, avec des résolutions de 7 à 75 µm et pour des volumes allant de 15 à 300 mm. Cela permet d’augmenter significativement notre production. Environ 1 000 spécimens sont prévus sur la période 2024–2026.
